1、專利保護有期限性。根據我國《專利法》規定，發明創造包括三類，即發明、實用新型和外觀設計。其中發明專利權的保護期限為20年，實用新型專利權和外觀設計專利權的期限為10年。這表明，一旦發明創造獲得專利權后，最多只能獲得20年的法律保護。超過這一期限，企業的發明和技術創新將被置于公眾領域，無償貢獻給社會，任何企業均可免費使用該發明或技術創新。
2、專利保護破壞秘密性。因為申請專利必須將企業的發明創造公之于眾，使該技術成為公知技術，這樣，任何人都可以輕易獲得專利技術，因此，專利技術的公開化，無疑給不法企業侵犯專利權提供了現實條件。
3、專利保護會使得企業失去競爭力。科研成果被授予專利后，其他企業可以在已獲得專利的技術基礎之上，再發展成新的發明創造，獲得新的專利。盡管企業的專利仍然受到法律保護，但是同更新的技術相比已經處于劣勢，企業將失去競爭力。
4、專利保護有代價。申請專利需要支付一定的費用，而獲得專利后也要繳納年費。對于科研成果，企業應根據不同情況，選擇專利保護或商業秘密保護。